硕士论文知网查重算法的原理主要是通过比对文本内容的相似度来判断是否存在抄袭行为。该算法利用先进的文本比对技术，对上传的论文进行全文扫描，并与知网数据库中的文献进行比对，从而找出文本相似度较高的部分。同时，算法还会考虑到论文中的引用文献和参考资料，综合判断是否存在抄袭行为。

硕士论文知网查重算法还会对论文中的格式、排版、图片等元素进行检测，以进一步提高查重的准确性。此外，算法还会根据论文的语言风格、逻辑结构等特征进行分析，从而判断论文的原创性和学术水平。总的来说，硕士论文知网查重算法通过多维度的比对和分析，确保论文的学术诚信性和质量。